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物信息学是一门正在兴起的交叉学科，已成为当今生命科学和 自然科学的重大前沿领域之一。本 书概述了生物信息学的基本概念、的计算机基础和主要的信息学资源，介绍了 DNA序列分析、系统发育分析、基因组分析以及蛋白质组分析等分析方法、关键技术和常用软件。除列有阅读材料、参考文献和思考题外，还附录了生物信息学相关网址和刊物简介。

本书由复旦大学生命科学学院和计算机科学系“生物多样性信息学”联合研究组集体编著。本书内容新颖、简明扼要、篇幅适当，可作为生命科学和信息科学专业的高年级本科生、研究生教材。也可供其他专业师生和科研人员学习参考。

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书籍介绍

物信息学是一门正在兴起的交叉学科，已成为当今生命科学和 自然科学的重大前沿领域之一。《简明生物信息学》概述了生物信息学的基本概念、必备的计算机基础和主要的信息学资源，介绍了 DNA序列分析、系统发育分析、基因组分析以及蛋白质组分析等分析方法、关键技术和常用软件。除列有阅读材料、参考文献和思考题外，还附录了生物信息学相关网址和刊物简介。

《简明生物信息学》由复旦大学生命科学学院和计算机科学系“生物多样性信息学”联合研究组集体编著。《简明生物信息学》内容新颖、简明扼要、篇幅适当，可作为生命科学和信息科学专业的高年级本科生、研究生教材。也可供其他专业师生和科研人员学习参考。

• 作者： 刊谬补缺 发布时间：2016-06-07 00:47:08

  我天啦，架构抄贡布里希世界小史吧？原书也是儿童读物呀，而且结构章节很清晰啊，到这成注水过期猪肉了。中文翻译CCTV教科书腔好严重，感觉到睡前故事场景了

• 作者： 放开那个西红柿 发布时间：2017-01-09 16:35:50

  Nice one.

• 作者： Ithaka 发布时间：2015-10-28 23:26:22

  原来有些书得到一个地方才能读懂

• 作者： mOco 发布时间：2017-09-21 10:53:18

  继续#拒绝碳水四个字也能写一本书系列#

• 作者： 苗儿 发布时间：2010-10-24 22:44:02

  恩。。。

• 作者： 羡鱼 发布时间：2022-03-09 10:45:42

  3.5

• 探讨托尔斯泰之《复活》中的托尔斯泰主义

  作者：麓麓 发布时间：2005-10-10 20:47:12

  托尔斯泰主义：道德的自我完善，不以暴力抗恶，博爱。

  1．

  道德的自我完善

  在俄罗斯，其世界观所倡导的不是传统意义上的人道主义，而是基督教人道主义，神人性和上帝的内在性。在托尔斯泰主义中，表现为“道德的自我完善”。

  在《复活》中他写道：“一个是精神的人，他为自己所寻求的仅仅是对别人也是幸福的那种幸福；另一个是兽性的人，他所寻求的仅仅是他自己的幸福，为此不惜牺牲世界上一切人的幸福。”

  在托尔斯泰看来，道德的自我完善便是抛弃利己主义，投身到利他主义中来。一个人，如果仅仅为自己而活，为了自己而不惜牺牲其它人幸福的权利，那就是一个不道德的人，还没有找到生命的意义的人，而生命的真正意义就是在于为了他人牺牲自己。

  如果想做一个道德完善的人，需要经受很多考验，因为在人心中那个兽性的人会不断站出来试图掩盖每个人温良的本质，诱惑人要及时享乐。所以，当我们认识到自己内心的这种二重性，就不得不经常要进行道德的自我完善。

  在这里，我们会注意到“自我”两个字，也就是说，道德的完善不是来自外部，而是来自“自我”，《马太福音》的条条框框不足以约束我们成为一个善良的人，因为《圣经》中的所有箴言必须与我们内心的神，或者说“精神的人”相对话，相联系，才能得到呼应，才能使我们由内而发的改变。对心中的神的触发，往往只在一瞬间，爱情能让人看到内心的神的可贵，悔恨也能让人看到内心的神的可贵，甚至是罪恶也同样可以，只是在看到之时人们强迫自己把眼睛闭上，而纵身于罪恶给人们带来的片刻快感之中。

  “我要过人的生活。”托尔斯泰认为，真正的人是永远根据自己的良知做事，时时刻刻进行自我反省，以避免自己掉入堕落的深渊，即使曾经有过可鄙的生活，浑身罪孽深重，只要敢于呼唤自己的心中的上帝，勇敢面对以前和以后所有的时光，让“精神的人”永远站在“兽性的人”之上，那么就能拯救自己。

  “住在他心里的上帝，已经在他的思想感情里醒过来。他感到了上帝的存在，因此不但感到自由、勇气、生活的快乐，而且感到了善的全部威力。”在俄罗斯宗教哲学中，上帝不是至高无上的外在权威，而是在人的内心深处揭示出来的，或者说是在人生的痛苦与悲剧中找到的。不经历痛苦，甚至不经历罪恶，或许未必能发现人们心中的那个沉睡的上帝。只有沉入到自己灵魂的最深处，才能“与活的上帝相遇”。所以，在俄罗斯观念中，“拯救”与“恩典”也不是来自外部，而是在人的生命之中对上帝的内在把握，是对生命的精神改造。也许这种“拯救”不能带来任何外部利益，但对人的精神世界，对人的内部醒悟，有着不可磨灭的力量。

  但如果认为忏悔仅仅是为了自己的精神世界得以净化，那么也就不是托尔斯泰的本意了。一个正直而善良的人，只能是一个利他主义者，对自己的拯救是不能够抱着欣赏的态度，因为一旦如此，人就成为利用别人而使自己精神获益的人，况且这样一来，自己的内心也未必能够完全的净化了。

  人的忏悔不能让人死后升天堂，避免下地狱。因为人的心里本来是一个无边无际的空间，它不仅包含着上帝和魔鬼，甚至是包含着天堂与地狱。在这里，天堂和地狱不是死后才能经历的地方，而是在人的这一生，在人的现实生活中，就必定要经历的，是人的精神生命的不同状况的表现。

  别尔嘉耶夫精彩地表达了这一思想，他说：“地狱之悲剧不在于上帝不能为有罪者洗清罪孽，而在于有罪者自己不能给自己洗清罪孽；地狱不是有罪者在其中受苦的外在环境，而正是一种绝对的孤独，在这里，生命中被压低的良知的呼声，用可怕的不灭之火焚烧着罪孽者。”

  2．

  不以暴力抗恶

  这里或许可以看作利他主义的另一个表现：不能损害他人的利益。

  看起来，不能损害他人的利益似乎比利他主义降低一个级别，其实这一点恰恰更难以达到，这不仅表明，我们不能牺牲他人的幸福，甚至还表明，我们不能以某种崇高的理由为前提，以牺牲自我为前提，以未来的天国降临为前提而牺牲他人的幸福。

  从统治者角度看，运用暴力是错误的，托尔斯泰在他的《复活》中反复强调：“要克服使人们饱受苦难的骇人听闻的罪恶，唯一可靠的办法，就是在上帝面前承认自己总是有罪的，因此既不应该惩罚别人，也无法纠正别人。”“腐化堕落的人想去纠正腐化堕落的人，并想用生硬的方法达到目的，结果是缺钱而贪财的人就以这种武力惩罚人和纠正人作为职业，自己却极度腐化堕落，同时又不断腐蚀受尽折磨的人。”“要永远饶恕一切人，要无数次地饶恕人，因为世界上没有一个无罪的人，可以惩罚或者纠正别人”。

  从革命者的角度看，以暴力抗恶也是不可取的。因为，暴力革命的关于遥远将来的绝对幸福的抽象理想扼杀了人对人的具体道德关系，扼杀了对切近的当代人的关怀，也扼杀了当前世界中需要的爱这种活的情感。可以从各国的历史中看到，革命者不仅勇于自我牺牲，还要求自己的朋友、家人，从更广的意义上说是要求他人也要自我牺牲，如果不勇于牺牲的，就是怯懦，是对强权的惧怕。这样，革命者就演变成为不尊重他人生命的人，以牺牲他人利益来达到革命目标的人。革命者当然也追求人类幸福，但他所爱的以非活生生的人，而是思想，亦即全人类幸福的思想。

  在托尔斯泰的心中，上帝和天国是在人的心中的，妨碍人间天堂的仍旧是人的心中难以摆脱的魔鬼，而暴力革命者认为，妨碍人间天堂之建立的原因不在人的内部，而在人之外——在于他的社会状况，在于社会机制的不完善。由于这个外部原因，因此只能用外部的、机械的手段来消除。那么魔鬼从“自我”的内部被移植到外部社会机构，人与人本应努力创造的爱被改写成人们对社会机制的恨。这样，革命就从本来意义上的建设性或创造性的事业，变异成为消除和消灭障碍，也就是破坏。

  因此，从对未来人类的巨大的爱中产生了对人的巨大的恨，建立人间天堂的激情变成了破坏现实世界的激情。革命者的破坏的心理动机和伴随物永远是恨。革命者认为他们有恨的责任，恨在他们生活中起着深刻的和充满激情的伦理动机的作用。

  那么，从这一方面来说，托尔斯泰的不以暴力抗恶非但并不是所谓的反动说教，而相反是对人性的关爱，对人的善良和怜悯的催化。

  3．

  博爱

  这一点和上一点是相连的。博爱是基督教精神的一个重要组成部分，也是托尔斯泰主义的一个重要组成部分。在《复活》中，“博爱”几乎可以同“宽恕”等同，因为博爱的最大障碍就是人们不能对伤害过自己的人宽恕。一个人如果不能宽恕别人，人的内心就很容易被“恨”的感情所占据，恶是世界无法和谐、无法共生的根源，恨也一样，而恨往往是因为人们遭受了恶的摧残而造成的。

  托尔斯泰认为，既然人人心中都是有罪孽的，因此人是不能通过惩罚和报复别人来消灭恶从而寻求自己的安宁，人人都没有这个权力。但是愤恨占据的人的内心而无法使其平静，那么获得安宁的另一个手段只能反其道而行，那就是“宽恕”。一旦宽恕别人，人就可以站在一个更高的层次上，来面对一切不平等和不公正。

  我们也知道，虽然在很多时候，宽恕是不能让作恶的人醒悟，也不能使恶真正消除，也许还可能让作恶的人更加为所欲为，但至少，那些宽恕别人的人从此可以给世界带来更多更无私的爱，可以挽留住人与人之间的理解与友爱。反之，一旦开始报复，作恶方也不一定会善罢甘休，也会同样变本加厉报复，长此以往，所有的爱将会消失殆尽，那么地狱会降临在每个人的心中，那将是更为可怕的。

  4．总结

  毋庸置疑的是，人的精神的升华和人的成长，不仅意味着对现实恶的否定，也意味着对产生这种恶的社会根源的否定。小说的这一思想是深刻而积极的。在作品中，作者对沙皇俄国时代的一切国家制度、社会制度、教会制度和经济制度作了强烈的批判。但是，如果我们仅仅认为作者的这些否定与批判思想是积极的，而托尔斯泰主义是消极的，那么在我看来，否定和批判却不是最有价值的，因为，这个世界只有否定和批判是不够的，重要的是在否定和批判中建构一种新的、值得肯定的东西，《复活》中的否定和批判让我们的思维明朗，而肯定和建构是让我们的灵魂感动。简单的宣称托尔斯泰主义是一种消极的说教是对作者的不恭敬，不论托尔斯泰主义是否太过理想化，毕竟那是作者一生思想的沉淀的精华。

• 从秦至清到底是什么社会？——读冯天瑜《“封建”考论》

  作者：人生天地间，忽如远行客 发布时间：2007-01-15 00:21:57

  封建社会是我们经常用到的词句，说到新中国成立之前的社会，我们就说是半封建半殖民地，再往前说就是封建社会，一上小学就这样讲，然后中学、大学继续强化。即便没有上过学的人也对这个词不陌生，一说谁思想陈旧就说是老封建，谁迷信就是封建迷信，封建成了落后、保守的代名词，可以说，封建这个词已经严重泛化。

  但是，仔细想来，这个词用得并不准确，因为不符合“封建”的本意，学术界已经有不少人对此产生质疑，比如，思想解放的先驱人物李慎之、王元化就屡有议论，李先生坚决反对“封建”一词的滥用，他说“严守学术标准，不肯随声附和的史学家是决不如此滥用“封建”一词的。不信，你查一查一生“未尝曲学阿世”的陈寅格先生的文集，决不会发现他会在任何地方把秦始皇已经‘废封建、立郡县’以后的中国社会称作‘封建社会’。王元化先生说：“秦始皇统一中国后，就已经不再是封建制了。比较准确的说法是君主专制中央集权的大一统政体。这跟西方说的‘封建制度’完全两样。”武汉大学冯天瑜先生更推出了专著《“封建”考论》。对“封建”概念的古今沿革、东西对接作了系统梳理。

  冯天瑜认为，在20世纪初叶之前，中国传统经史语汇中“封建”一词与“郡县”相对，专指封邦建国，语义明确；19世纪后半叶，日本及中国启蒙学者以“封建”对译西语“feudalism”，基本恰当。20世纪30年代以来，“封建”之义在中国发生了重大变异，日趋泛化。这种“泛化封建观”，与马克思主义的封建社会原论、中国传统文化的经史原义、中日启蒙学者的早期原译“名实错位，形义脱节”。这对我们重新认识封建问题很有启发。

  封建本义为“封土建国”、“封爵建藩”，秦汉以后的中国社会就已经不是这样子了，所以在秦至清的2000多年间，并没有人说这是封建社会，只是到了清末民初，尤其是五四以后，人们才开始用封建社会来概括这一社会历史时期，并有了“反封建”、“半封建”的说法，有了何时中国开始封建社会的论战。封建之所以泛化，一个重要的原因是因为许多人认为这是马克思的观点。而马克思的观点当然是“放之四海而皆准”的，但是，冯天瑜先生在研究中却得出结论“泛化封建观与马克思封建社会原论相悖”，理由是：第一：秦汉至明清，农业生产者的主题是人生大体自由的农民而并非有法定人身依附的农奴，不存在占优势地位的农奴制；第二。自战国以降，土地可以买卖转让，贵族世袭土地制不占主导；第三，中国有着比印度更加完备、更加强势的重要集权君主制度，阻止向西欧国家权力分散的领主封建制那样的社会形态发展。子曰：必也正名乎！那么既然秦至清不是封建社会，应该叫做什么社会呢？冯天瑜认为：宗法地主专制社会（简称地主社会），可以昭示两千余年间社会组织、经济结构、政治体制诸层面的基本特征。但是，“封建”一词确实已约定俗成，改变也是极为困难的事情，我想首先是要让知识界和知识分子知道，封建社会这个词并不准确，而且尽量减少这个词的泛化，然后再逐步考虑用什么样的词来取代封建社会的提法。

  原文地址：

  http://guancha.gmw.cn/show.aspx?id=2998

  作者的博客：

  http://liuxi.blshe.com/